西安市中医医院肛肠科经评审和审批，于2003年12月26日正式更名为西安市肛肠病医院，同时被市卫生局批准为西安市重点专科，经过一年时间运行和建设，软硬件都得到了发展。
人员梯队更趋合理，专科设备也有了增加，经全科共同努力，学术地位在国内有了很大提高。科学管理，技术创新带来了两个效益的增加，2003年门诊量11693人次，收治住院病人996例，床位使用率100.03%，总收入1000万元人民币。保持和巩固了在省内及西部地区的领先地位。
西安市肛肠病医院设在西安市中医医院外科楼。布局合理，通风透光，病房设施合理，患者及工作人员环境舒适。肛肠门诊设在医院门诊楼四层西侧。病房设90张床，可容纳110余患者住院。医院分为一、二、三病区。
学科带头人
学科带头人贺向东，大学本科毕业，现年50岁，主任医师，副教授，西安市肛肠病医院院长，肛肠科主任。现任中华中医药学会肛肠专业委员会副会长、中国中西医结合大肠肛门病专业委员会常委、陕西省肛肠专业委员会会长、中国社会科学院研究员、陕西省中西医结合专业委员会常委、陕西省医疗事故鉴定委员会委员、陕西省卫生高级职称评审委员会委员、西安市医学会理事、西安市医疗控制专家组成员、全国肛肠防治新进展新技术研修班、陕西省中西医结合肛肠病研修班继续教育项目负责人。